近20年來(lái),分子生物學(xué)發(fā)展的一個(gè)顯著特點(diǎn)是生物信息的劇烈膨脹,且迅速形成了巨量的生物信息庫(kù)。這里所指的生物信息包括多種數(shù)據(jù)類(lèi)型,如分子序列數(shù)據(jù)(核酸和蛋白質(zhì))、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)和三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)等(詳見(jiàn)第1-1章)。由測(cè)序儀...[繼續(xù)閱讀]

    生物信息學(xué)學(xué)科是在生物信息急劇膨脹的壓力下誕生的。生物信息學(xué)的誕生和發(fā)展最早可以追溯到20世紀(jì)60年代,而“生物信息學(xué)(Bioinformatics)”一詞的出現(xiàn)則是在1990年(詳見(jiàn)下節(jié))。一般意義上,生物信息學(xué)是研究生物信息的采集、處理...[繼續(xù)閱讀]

    生物信息學(xué)的誕生和發(fā)展最早可以追溯到20世紀(jì)60年代,兩屆諾貝爾獎(jiǎng)得主鮑林(L.C.Pauling)分子進(jìn)化理論的出現(xiàn)(利用蛋白質(zhì)序列進(jìn)行進(jìn)化分析),已預(yù)示著生物信息學(xué)的來(lái)臨。1956年在美國(guó)召開(kāi)首次生物學(xué)中的信息理論研討會(huì),有學(xué)者將其作...[繼續(xù)閱讀]

    雖然是一門(mén)年輕學(xué)科,但生物信息學(xué)對(duì)整個(gè)生物學(xué)發(fā)展產(chǎn)生了巨大推動(dòng)作用。Nature總結(jié)了生物學(xué)領(lǐng)域引用率最高的100篇論文,生物信息學(xué)(包括系統(tǒng)進(jìn)化方面)共有10篇入選,其中1篇甚至進(jìn)入前十(表0-1.3)。表0-1.3　生物學(xué)學(xué)科歷史上引用率...[繼續(xù)閱讀]

    蛋白質(zhì)、DNA 和RNA 序列的計(jì)算分析在不斷發(fā)生著變化。生物學(xué)實(shí)驗(yàn)新技術(shù),如測(cè)序技術(shù)使實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)急劇增長(zhǎng),當(dāng)基因組測(cè)序計(jì)劃持續(xù)開(kāi)展,生物信息學(xué)研究重點(diǎn)已逐步從數(shù)據(jù)的積累轉(zhuǎn)向數(shù)據(jù)的解釋。用于基因組拼接、序列相似性搜索、...[繼續(xù)閱讀]

    本書(shū)定位為生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)生的入門(mén)教材和非生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)生及科研工作者的基本教材。因此,本書(shū)的閱讀對(duì)象建議為本科生、研究生階段學(xué)生和從事生物學(xué)及相關(guān)專(zhuān)業(yè)領(lǐng)域(如醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等)研究與開(kāi)發(fā)工作者。本書(shū)共分為四...[繼續(xù)閱讀]

    1.核苷酸序列數(shù)據(jù)常見(jiàn)的核苷酸序列數(shù)據(jù)由脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)數(shù)據(jù)組成。DNA 的組成單位為四種脫氧核糖核苷酸,分別為腺嘌呤(A)、鳥(niǎo)嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。而RNA 的組成單位為四種核糖核苷酸,分別為腺嘌呤...[繼續(xù)閱讀]

    1.雙脫氧鏈終止法(Sanger 法)第一代DNA 測(cè)序技術(shù)主要為1977年由桑格(Sanger) 等提出的雙脫氧鏈終止法(dideoxy sequencing technique),也稱(chēng)為Sanger 法。Sanger 法的核心原理是:雙脫氧核糖核苷酸(ddNTP)的2′和3′位置都不含羥基(圖1-1.1右),因此ddNTP 在...[繼續(xù)閱讀]

    隨著研究的不斷深入,第一代測(cè)序技術(shù)由于其成本高、通量低等缺點(diǎn),越來(lái)越滿(mǎn)足不了日益發(fā)展的生物研究需求,并且難以實(shí)現(xiàn)大規(guī)模的應(yīng)用。經(jīng)過(guò)不斷的技術(shù)研發(fā)和改善,同時(shí)具備成本低、通量高、速度快等特點(diǎn)的第二代測(cè)序技術(shù)應(yīng)運(yùn)...[繼續(xù)閱讀]

    第二代測(cè)序技術(shù)具有通量大、時(shí)間短、精確度高和信息量豐富等優(yōu)點(diǎn),但是仍不能滿(mǎn)足日益深入的研究工作,因此第三代測(cè)序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。第三代測(cè)序(third generation sequencing,TGS)是基于單個(gè)分子信號(hào)檢測(cè)的DNA 測(cè)序,也被稱(chēng)為單分子測(cè)序...[繼續(xù)閱讀]