扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組分析
昆蟲學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù)： 9 2017-01-20
摘要： 【目的】建立扶桑綿粉蚧Phenacoccus solenopsis Tinsley的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù),揭示扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組的整體表達(dá)特征。【方法】采用Illumina Hi SeqTM40`00測(cè)序平臺(tái)開展對(duì)扶桑綿粉蚧雌成蟲轉(zhuǎn)錄組測(cè)定,對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾和組裝?！窘Y(jié)果】共獲得58 322 258條序列讀取片段(reads),共9.48 Gb(Gen Bank登錄號(hào):SAMN06130426)57 422 032條有效轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。進(jìn)一步組裝拼接后,共獲得94 475個(gè)單基因簇(unigene),平均長(zhǎng)度為700 bp。將unigene與數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行BLASTX比對(duì),成功注釋20 949個(gè)unigenes,其中,Nr注釋的unigenes與豌豆蚜Acyrthosiphon pisum unigenes同源性最高,達(dá)18.69%。扶桑綿粉蚧轉(zhuǎn)錄組unigenes根據(jù)GO功能注釋大致可分為細(xì)胞組分、分子功能和生物過程三大類55個(gè)分支,與結(jié)合活性、催化活性、細(xì)胞進(jìn)程和代謝進(jìn)程相關(guān)的unigenes較多。此外,本研究還篩選到20條與脂類代謝相關(guān)的途徑和與性信息素代謝相關(guān)的序列。并通過與Nr和Swiss-prot蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),獲得了15 037條編碼序列(CDS)片段?！窘Y(jié)論】本研究初步闡明扶桑綿粉蚧雌成蟲轉(zhuǎn)錄組的整體表達(dá)模式,為進(jìn)一步研究扶桑綿粉蚧的基因功能及性信息素的代謝途徑奠定了基礎(chǔ)。 （共9頁(yè)）
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